南开大学是一所综合性大学，文理学科兼备。在MBA项目发展过程中，学院充分运用这一优势，为学生开发了相关课程，提供了重要资源和保障条件。
南开大学商学院领先的、前沿的学术研究为开展教学活动提供了丰富的内容，既凸显了学院的研究优势，又凸显了人才培养的特色。而MBA项目拓展了教师接触企业实践的路径，是管理学科挖掘实际问题、探索科学问题、实现可持续发展的基础和重要的战略性资源。
MBA中心采取“以教学为中心的学生自我管理”的管理方法。坚持以MBA教学为中心的原则，充分发挥学生自身的主观能动性，让学生直接参与到教学管理、项目设计、改革创新等工作中来。
南开大学MBA教育项目将实践性贯穿于招生、培养、就业的全过程。学院设置了MBA实践教学指导委员会，成员来自企业高管和政府官员等，在中国MBA教育中采取了双导师制、“双师”授课、走出校园与企业家同堂上课、鼓励学生免费为企业开展管理咨询，还开办了企业家大讲堂、跨国公司在中国等系列讲座。
南开大学MBA项目虽然在全国都是设立最早的，但20多年来始终注重通过教学和管理创新来引领发展。例如在全国最早实施双导师制度，最早组织MBA联合会主席论坛，最早开设公司治理、创业管理、服务管理和项目管理等课程。
南开大学商学院MBA项目一直强调国际合作。2011年11月，受邀加入由前意大利总理普罗迪发起的，由意大利、美国、巴西和俄罗斯的四所大学组织的 MBA/EMBA国际交流联盟，成为该联盟的第五所院校。目前，南开大学商学院MBA/EMBA项目已经与英国帝国理工大学、奥地利格拉茨大学、瑞典延雪平大学、韩国首尔大学、日本一桥大学、美国哈佛大学、新加坡南洋理工大学、澳大利亚新南威尔士大学等几十所院校建立了学术交流、学生互派等活动。国际化将继续作为MBA项目持续改进计划的重点。
南开大学MBA项目自2011年开始推行MBA教学改革新政策。教学改革以提高实践能力为突破口，在招生—课程设计与开发—教学过程—论文指导—职业辅导—职业生涯发展的全过程中贯彻实践教学的理念。
